MR T1 görüntüleme klinikte rutin olarak yapılmaktadır. Bu çekimlerin bazıları ise volümetrik olup değişik sekanslarda yapılmaktadır. Bilindiği üzere beyin içerisinde hipokampüs hafızayla ilgili, serebellum ise dengeyle ilgili önemli yapılardır.
Hipokampüste olan hacimsel değişiklikler ise başta Alzheimer ve demansta, serebellum ataksilerde, talamus ise şizofrenide, tremorda oldukça önem arz etmektedir. Günümüzde farklı yazılımlar kullanılarak hipokampüs, serebellum ve talamus hacimleri ölçülmektedir. Bu yazılımların bazıları otomatik bazıları ise yarı otomatiktir.
Bu kursta otomatik olarak kullanılan ve bilimsel geçerliliği tüm dünyada kabul görmüş Volbrain/HIPS, CERES ve DeepNuclei kullanılarak hipokampüs kısımları, talamus .ekirdekleri, serebullum löbülleri parselasyon haritaları elde edilecektir.
Volbrain web adresine (https://www.volbrain.net/) girilerek önce kayıt oluşturulacaktır. VolBrain, MR T1 görüntülerinin yüklendiği ve sonuçların birkaç dakika sonra elde edildiği ücretsiz bir bulut sistemidir. Burdan indirilen sonuçlar ITKSnap ile üç boyutlu görüntülenecek ve kayıt edilecektir. Aynı zamanda burdan STL formatında kaydedilen üç boyutlu STL formatındaki dosyalar direk üç boyutlu yazıcılardan da çıktı alınabilmektedir.
Kursa katılan katılımcılar volbrain sistemi ile dosyalarını yükleyecek, hacim sonuçlarını elde edecek ve ITKSnap ile de üç boyutlu görüntüleyebileceklerdir.
Konu ile ilgili bu sistem kullanılarak beyinle ilgili tüm hastalıklarda hipokampüs kısımları, srebellum löbüllerinin ve talamus çekirdeklerinin hacimlerinin değişip değişmediğini göstermek için tez, yayın ve proje yapılabilir.
Not: Katılımcılar kendi laptopu ile çalışacaklardır. Bilgisayarların en az 4 GB RAM ve en az i5 işlemcisi olması ve yeterli depo yeri olması önerilir. Bilgisayarlarda Windows tabanlı işletim sistemi olması gerekmektedir. Kurs katılımcıların isteğine göre de online da olabilir.